A Protein Complex Network of Drosophila melanogaster

نویسندگان

  • K. G. Guruharsha
  • Jean-François Rual
  • Bo Zhai
  • Julian Mintseris
  • Pujita Vaidya
  • Namita Vaidya
  • Chapman Beekman
  • Christina Wong
  • David Y. Rhee
  • Odise Cenaj
  • Emily McKillip
  • Saumini Shah
  • Mark Stapleton
  • Kenneth H. Wan
  • Charles Yu
  • Bayan Parsa
  • Joseph W. Carlson
  • Xiao Chen
  • Bhaveen Kapadia
  • K. VijayRaghavan
  • Steven P. Gygi
  • Susan E. Celniker
  • Robert A. Obar
  • Spyros Artavanis-Tsakonas
چکیده

Determining the composition of protein complexes is an essential step toward understanding the cell as an integrated system. Using coaffinity purification coupled to mass spectrometry analysis, we examined protein associations involving nearly 5,000 individual, FLAG-HA epitope-tagged Drosophila proteins. Stringent analysis of these data, based on a statistical framework designed to define individual protein-protein interactions, led to the generation of a Drosophila protein interaction map (DPiM) encompassing 556 protein complexes. The high quality of the DPiM and its usefulness as a paradigm for metazoan proteomes are apparent from the recovery of many known complexes, significant enrichment for shared functional attributes, and validation in human cells. The DPiM defines potential novel members for several important protein complexes and assigns functional links to 586 protein-coding genes lacking previous experimental annotation. The DPiM represents, to our knowledge, the largest metazoan protein complex map and provides a valuable resource for analysis of protein complex evolution.

برای دانلود رایگان متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

ثبت نام

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Aconitase and Developmental EndPointsasEarly IndicatorsofCellularToxicity Induced by Xenobiotics in Drosophila Melanogaster

Background: In this study, the toxicity of the different xenobiotics was tested on the fruit fly Drosophila melanogaster model system.  Methods: Fly larvae were raised on food supplemented with xenobioticsat different concentrations (sodium nitroprusside (0.1-1.5 mM), S-nitrosoglutathione (0.5-4 mM), and potassium ferrocyanide (1 mM)). Emergence of flies, food intake by larvae, and pupation h...

متن کامل

Concentration dependent effect of morphine, aspirin, capsaicin and chili pepper hydro alcoholic extract on thermal and chemical pain model in fruit fly (Drosophila melanogaster)

Introduction: Pain research using animal models is related to ethical concerns, so invertebrates and insects have been recommended by researchers. In the present study, the nociceptive and antinociceptive effects of capsaicin, aspirin, morphine and chili extract were examined using fruit fly (Drosophila melanogaster) as an alternative for rodent pain model. Methods: Stage 3 of larvae and ad...

متن کامل

Toxicological Evaluation of a New Lepidopteran Insecticide, Flubendiamide, in Non-Target Drosophila melanogaster Meigen (Diptera: Drosophilidae)

Background: Flubendiamide, comparatively a new pesticide designed to eradicate lepidopteran insect pests is known to have low risk to birds, mammals, fish, algae, honey bees, non-target arthropods, earthworms, soil macro- and micro-organisms, non-target plants as well as sewage treatment organisms; however, the risk assessment for aquatic invertebrates from metabolite could not be finalized wit...

متن کامل

Overall D. melanogaster Cohort Viability as A Pollution Indicator of the Atmospheric Air of Urban Landscapes

The method of air pollution level evaluation of urban landscapes on the basis of D. melanogaster cohort analysis has been suggested. The method implies the binding to the landscape areas of the city. Within each landscape area traps and cultivators for D. melanogaster have been installed in sanitary-protective zones of various enterprises as well as on the background territory with the least le...

متن کامل

بررسی اثرات عصاره آبی زعفران (Crocus sativus) بر اندازه لاروهای مگس سرکه (Drosophila melanogaster) در بازه‌های زمانی مختلف مرحله لاروی

چکیده گیاه زعفران(Crocus sativus) ، گیاه بومی کشور ایران و خصوصا منطقه خراسان می­باشد و دارای جایگاه خاصی در الگوی تغذیه مردم می­باشد. با توجه به مطالعات متعدد اثرات زعفران و از آنجا که در زمینه اثرات آن بر روند تکوین مگس سرکه به عنوان یک مدل جانوری مطالعات خاصی صورت نگرفته، در این مطالعه اثرات زعفران بر اندازه لاروها در حین تکوین، مورد بررسی قرار گرفت. تعداد 5 جفت مگس سرکه وحشی بالغ سه روزه جه...

متن کامل

بررسی اثرات عصاره آبی زعفران (.Crocus sativus L) بر درصد تبدیل لارو به شفیره و شفیره به بالغ در مگس سرکه (Drosophila melanogaster M.)

زعفران (Crocus sativusL.)، گیاه بومی کشور ایران و خصوصاً منطقه خراسان هست و دارای جایگاه خاصی در الگوی تغذیه مردم می‌باشد. با توجه به مطالعات متعدد اثرات زعفران و ازآنجاکه در زمینه‌ی اثرات آن بر روند تکوین مگس سرکه به‌عنوان یک مدل جانوری مطالعات خاصی صورت نگرفته، در این مطالعه اثرات عصاره آبی زعفران بر درصد تبدیل لارو به شفیره و شفیره به بالغ در مگس سرکه‌ در ح...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

عنوان ژورنال:
  • Cell

دوره 147  شماره 

صفحات  -

تاریخ انتشار 2011